会社に内緒の副業がバレたら大問題＾＾；
だから確定申告しない。。。

良く分かりますが確定申告してもしなくても、
ほったらかしだとバレます

住民税でバレるんです。
住民税を会社分と副収入分を一緒に徴収すると会社に通知がいっちゃいます。
そこでバレるんですが、ならば一緒に徴収しないようにすればいいだけのこと。
申告用紙の時に「確定申告第二表」の右下のほうを見ると、
「住民税・事業所税に関する事項」の
「給与所得以外の住民税の徴収方法の選択」に注目。
「自分で納付」（普通徴収）にチェックするだけ、
「事業所得」「雑所得」はこれでOKです。

逆に、２箇所とも給与所得だと市役所や区役所に
バレないようにとお願いするしかありません。
まずは税務署に相談しましょう＾＾；